Nové Y-ové haplogroupy na 23andMe

Tenhle týden se nám dostalo nového hezkého update od 23andMe. Máme teď k dispozici Y haploskupiny založené na snipech - alternativních DNA bazích. Bohužel se tahle novinka dostala jen na jejich nové stránky (a tam zatím Evropany nepouštějí).

Tady to podrobně popisují v blogu: https://blog.23andme.com/ancestry/updates-to-23andme-paternal-haplogroup-assignments/

My se zaměříme na podstatu změny.
Na začátku se Y strom tvořil pomocí písmen a číslic. Pokud jsme měli nějakou haplogrupu, např. R, tak první rozvětvení jsme označili jedničkou, další dvojkou, atd.: R1, R2. Pro další větvení jsme použili písmena - R1a, R1b, a pak zase čísla R1a1, R1a2 atd.
Problém byl v tom, že nalezení nových dělení nám mohlo (a typicky taky dělalo) tyhle větvení přeházet. Čím blíže současnosti, tím víc se vše měnilo a nebylo stabilni.
Proto jsme zavedli definici pomocí snipů - ty označují, která konkrátní mutace k danému větvení vedla. Pokud došlo mutací na pozici L160 k vytvoření nové větve, je jedno jestli je třetí nebo patá. Tohle značení je mnohem stabilnější.

A tohle tedy David Poznik, skvělý výzkumník chromozomu Y, na 23andMe zavedl.
Obnovil údaje na úroveň ledna 2016, pomocí ISOGG stromu.

Nyní tedy každý uvidí, jak vypadá jeho kousek Y linie:

Tohle hlavně zamezí zmatkům. Ani nevíte, kolikrát přišel do našeho FTDNA projektu nebo Facebookové skupiny někdo zcela popletený výsledky z 23andMe.

Rovněž bude mnohem jednodušší pomocí 23andMe výsledků objednat ten správný SNP panel z FTDNA nebo YSeq.

Skvělá práce od Davida, těším se, že o něm neslyšíme naposledy!
(pro technicky znalé - můžete se podívat na jeho prográmek, kterým výsledky zaktualizoval)

New Y haplogroups at 23andMe

What a nice and useful update from 23andMe. We now have SNP-based haplogroup info! As expected, this feature only made it to new experience (yes, as a European, I am still at the old one).

The blog: https://blog.23andme.com/ancestry/updates-to-23andme-paternal-haplogroup-assignments/
What do we have here?
David Poznik, great Y chromosome researcher, is working hard to bring us some improvements.
He has updated all the results to recent (January 2016) ISOGG phylotree.

Now everyone will have a small image representing his position in the tree:

First and foremost, this will help reduce confusion, as unexperienced users often didn't understand the old notation, it's relation to the new SNP one. (People were coming to my FTDNA project of Facebook group with misunderstandings from 23andMe all the time.)

It will be also easier to jump to SNP panels at FTDNA or YSeq based on this info.

All-in-all great work from David, and I hope to see more from him!
(For tech savvies, you can check out his utility they used for this haplogroup update.)