Vše nej v roce 2018!

Doufám, že jste všichni měli moc povedené Vánoce a užili si spoustu času s rodinou. Mně se povedlo vidět přes Vánoce všechny své žijící předky (i všechny ostatní žijící předky mých dětí) a taky se potkat se všemi svými sourozenci a všemi jejich dětmi. Velmi úspěšné Vánoce :)

V tomhle blogu bych chtěl zrekapitulovat cíle, které jsem si tady vytyčil na rok 2017, a jak moc se povedlo je splnit.

Rychlá rekapitulace cílů:

1. Mít zdravého syna.
2. Zdokonalit rodokmen.
   2.1. Identifikovat 40% předků do 10té generace, tj. 818 předků (z  2046ti).
   2.2. Nalézt polovinu předků mého dědy z otcovy strany v 7mé generaci - tj. 64.
3. Napsat sérii blogů v češtině pro začátečníky s genetickou genealogií.
4. Najít alespoň jednoho z mých dvou nejbližších neznámých předků.
   4.1. Tento cíl zahrnuje sběr maximálního možného počtu relevantních DNA vzorků.
   4.2. Pracovat na rekombinační mapě otcovských chromozomů.
5. Otestovat naše děti.
6. Začít sloupek "Předek týdne" - kde bloguju o jednom ze svých zesnulých předků.
7. Pokračovat v práci s genetickýma shodama.

Rád bych začal těmi nejůspěšnějšími:

1. Mít zdravého syna.

Ano! Vítek je prostě super (už umí říkat "táta"), a navíc se mi díky energii z jeho narození podařilo prohloubit znalosti otcovské linie Krcháků.

2.2. Nalézt polovinu předků mého dědy z otcovy strany v 7mé generaci - tj. 64.

Díky velmi intenzivní práci s předtolerančními matrikami jsem dokázal tenhlé cíl splnit. Třikrát hurá!

7. Pokračovat v práci s genetickýma shodama.

Práce s genetickýma shodama mě bavila a myslím, že se i dařila. Podařilo se mi nalézt společného předka pro několik amerických příbuzných (tak, že jsem prostě postavil jejich český rodokmen).
I napsat článek o shodách na 23andMe se podařilo.

U většiny dalších témat se podařilo dosáhnout častečného úspěchu:

2.1. Identifikovat 40% předků do 10té generace, tj. 818 předků (z  2046ti).

Dnes jsem na čísle 635 předků. Někteří trochu nejistí. To znamená roční nárůst známých předku o 24%. To mi přijde senzační, a původní cíl prostě příliš agresivní a nerealistický.

Pokud bych chtěl znovu mířit na 24%, můj nový cíl pro 2018 bude 788 předků.

3. Napsat sérii blogů v češtině pro začátečníky s genetickou genealogií. 

Tohle bylo hodně na poslední chvilku, ale povedlo se napsat úvodní blog o nejčastějším prvním setkáních českých genealogů s DNA - projektu Genetika a Příjmení.

4. Najít alespoň jednoho z mých dvou nejbližších neznámých předků. 

Na základě DNA testování mám teď kandidáta na otce mého prapradědečka Antonína Šuly, narozeného 1871. Je jím František Skrejšovský, 1837.

Další testování bude potřeba pro ověření této hypotézy.

Další neznámý předek bude těžší, díky kombinaci endogamie na Horňácku a malého množství Čechů s autozomálními testy.

5. Otestovat naše děti.

Další úspěch na poslední chvíli. Posílal sem testy svých dcer do 23andMe z více než hodinové fronty na poště v Seattlu až 23tího prosince. Byl jsem příjemně překvapen, že i ta mladší, tříletá, dokázal naplivat plnou zkumavku (snad, ověřené z laboratoře to zatím není).

Můj nejmladší je zatím bez testů, vyhlížím nový GSA chip od FTDNA...

Úplné selhání:

6. Začít sloupek "Předek týdne".

Bohužel, předek týdne je to jediné, co jsem v roce 2017 vůbec nestihl. Snad nám to všem vynahradím v 2018!

Tak jsme si to pěkně shrnuli a já už se těším, až se s vámi podělím o plány na rok 2018. A doufám, že vám se povedlo ty vaše plány splnit ještě lépe, než mě.

All the best in 2018!

  Hope you all had a great holiday season to round up 2017 with great family time. During the holidays I was able to meet all of my living ancestors, as well as all of my siblings and their kids, so I am definitely satisfied.

What I want to achieve in this blog post is wrapping up last year with the evaluation of my 2017 goal set, so I can improve setting up a more realistic 2018 list.

Let's shortly revise what I set up to:

1. Have a healthy son introduced into the world. 
2. Improve the family tree. This has subgoals as per the latest 2016 balancing blog.
   2.1. Identify 40% of ancestors up to 10th gen - identify 818 ancestors (out of 2046).
   I currently [think I] know 512 of them. This means 306 new ancestors in 2017.
   2.2. Identify half of my paternal grandfather's 7th generation. I.e. 64 ancestors. 
3. Run a Czech series for newbies in genetic genealogy. 
4. Break one or both of my closest brick walls.
   4.1. This includes a sub-goal of gathering as much relevant samples as possible.
   4.2. Work on recombination map and chromosome coverage on paternal side.
5. Test my own children.
6. Start an "Ancestor of the week" feature - were I blog about one of my ancestors.
7. Keep working with my genetic genealogy matches (this includes 23andMe matches and the relevant goal mentioned in the recent 2016 balancing blog).

Let's start with the resounding successes:

1. Have a healthy son introduced into the world. 

Yes! Vitus is not only a great boy (he can already say "daddy"), I was able to deepen the knowledge of my paternal ancestry driven by my first born son - here. 100% complete

2.2. Identify half of my paternal grandfather's 7th generation. I.e. 64 ancestors. 

By very focused work, I was able to just achieve this goal! Yay!

7. Working with genetic matches.

I was definitely active in this direction and was able to map several US cousins to my tree (usually by building their own tree in the process).

On to the partial successes:

2.1. Identify 40% of ancestors up to 10th gen - identify 818 ancestors (out of 2046).

Well, today finds me at 635 ancestors. Some somewhat hypothetical. That is not too bad of a growth from the 512 I had last year (24%). I guess my goal was just too aggressive.

If I want to aim at another 24%, my goal for 2018 would be 788 ancestors.

3. Run a Czech series for newbies in genetic genealogy. 

This was a very small success at the last minute. I ran a blog about the most common Czech DNA test - Genetics and Surnames project.

4. Break one or both of my closest brick walls. 

Based on DNA testing, I now have a candidate father for my great-great-grandfather, Antonin Sula, 1871. The new supposed ancestor is Frantisek Skrejsovsky, 1837.

Further testing will be needed to verify this hypothesis.

The other MPE will be harder to identify, as there is quite heavy endogamy in the Hornacko region, and lack of Czech testers.

5. Test my own children.

This was another last minute save. We sent out my daughters tests to 23andMe on Dec 23rd. It was a pleasant surprise that my 3 year old was able to spit enough (not verified by the lab).

My youngest remains untested. I am kinda on a lookout for FTDNA move to GSA chip...

Total failure:

6. Start an "Ancestor of the week" feature - were I blog about one of my ancestors.

Well the Ancestor of the week is the only thing I have not managed to start in 2017. Hopefully, I can do better in 2018!

With that I am looking forward to the 2018 plan post and hope you all had better success planning your goals than I did.

Genetická genealogie pro začátečníky - Genetika a Příjmení - část 1

     Genetika a příjmení - část 1 - základy + hluboká minulost

Co jiného bych si mohl vybrat pro svůj první blog pro genetické genealogy začátečníky, než úspěšný český projekt "Genetika a Příjmení".

Že jste o něm ještě neslyšeli? Tak hybaj na stránky projektu. Tam se dovíte, že se jedná o projekt pro české (a hlavně prý moravské :) muže. Díky podpoře z grantů projekt umožňuje nechat si (na základě dostatečně zpracovaného rodokmenu) udělat zdarma základní STR test vašeho chromozomu Y. Tzn. nahlédnout trošku na kořeny vaší otcovské linie (otec otce otce otce otce ...).

Biologické a chemické stránce se budeme podrobněji věnovat v některém z dalších dílů, ale troška základů pro začátečníky. Chromozom Y je tzv. pohlavní chromozom, a má ho každý muž právě jednou (druhý pohlavní chromozom je X, který mají muži jednou, a ženy dvakrát).
Chromozom Y je specialní tím, že se jen s minimalními změnami (mutacemi) v každé generaci dědí z otce na syna.
A v době, kdy číst DNA nebylo vůbec jednoduché přišli vědci na zajímavý způsob jak změřit jak jsou si dva chromozomy Y vzdálené / blízké. Zjistili, že chromozom Y je protkán úseky, ve kterých se krátké kousky DNA (např. TCTA, ATT ap.) několikrát opakují - v angličtině "short tandem repeats", STRs. Takže když se podiváme na tyhle opakující se úseky, můžeme chromozom Y popsat. Např. se podíváme na dvanáct různých míst Y, 12 opakujících se kusů DNA - tzv. STR12.
Tím získáme sekvenci jako [14, 24, 15, 11, 14, 15, 11, 13, 13, 13, 11, 31].

Muže pak můžeme pomocí těchto počtů opakování STR porovnávat. Čím podobnější čísla, tím větší příbuznost.

A kolik těchhle STR čísílek člověk dostane z GAPu? 23. A kolik to teda vlastně je, dvacet tři? Inu, docela málo, člověku budou lehce vycházet jako genetické shody lidé, se kterými má společné předky třeba 2000 let v minulosti. Na tom není samo o sobě nic špatného, jen je třeba si to uvědomit, a s výsledky podle toho pracovat.

Tím jsme se oklikou dostali k tomu, co může člověk od výsledků čekat.

Jsou vlastně dvě hlavní kategorie.

1. Dávná minulost vaší otcovské linie. Díky tomu, jak se chromozom Y předává beze změn z otce na syna, je skvělou sondou do dávné minulosti vaší otcovské větve.
Umožňuje vám zjistit, kde vaši otcovští předci byli před 20ti, 10ti a pravděpodobně 2ma tisíci lety. (Ty 2 tisíce už vyžadují trochu štěstí a trochu práce).

Již docela dávno si lidé všimli, že ty STR čísla roztřiďují lidskou populaci do podobných tříd, tzv. "haploskupiny", nebo také haplogrup. Haplogrupy dostaly písmenka abecedy, kde úplně ta první, nejstarší, větev tzv. Y-chromozomálního Adama (praotce nás všech homo sapiens sapiens po otcovské linii) se jmenuje A. Velmi častá je skupina R, u nás pak druhá je skupina I.

Tyhle haploskupiny vlastně již tvoří strom (takový superhrubý rodokmen) našich otcovských linií:

(courtesy wikitree.com)

Tohle písmenko, pravděpodobně i s malým ocáskem dalších čísel a písmenek dostanete právě z GAP.
Tak hlavně, co ten ocásek? Je to vlastně docela jednoduché.
Písmenko vaší haplogrupy je první dělení. Představte si zjednodušeně, že to je váš prapra...prapraděda po otcovské linii.
Za písmenkem vždy následuje číslo, a za číslem zase písmenko.
Co tedy to první číslíčko znamená? Je to označení pořadí vaší podvětve, tedy zjednodušeně první syn (s unikátní mutací) ma číslo 1, třeba R1, druhý číslo 2, tj. R2, atd.
A v dalším kroku se zase jedná o větvení stromu (pořadí potomka), jen použijeme písmena, tj. R1a, R1b, atd.
Problém téhle notace je v tom, že se musela pořád předělávat, jak s dálším testováním přibývaly další větve. Takže se mohlo stát, že po chvíli se vaše I2b změnilo na I2a2 a pak na I2a2a atp.
Proto se dnes téměř bez výjimky přistupuje na notaci Jméno_haploskupiny-Jméno_SNP, např. I-M423.
A co je to teda to SNP? Česky čteme "snyp". SNP je "single nucleotide polymorphism" - místo v DNA, které může nabývat víc hodnot. Např. na pozici 16984211 máte třeba písmenko G nebo A. Pokud máte A, a jste právě v haplogrupě I, jste M423-pozitivní.
Pomocí těchto SNiPů se pak dá vybudovat ještě lepší strom, než pomocí STR.
Na jeden takový se můžete podívat na https://www.yfull.com/tree/.

Tak teď už snad trošku víte, co znamenají ta písmenka a čísla a můžeme se podívat na tu minulost.
Na české wikipedii je úplně strašně malinký popisek, ale je česky.

Zdaleka nejlepší místo, kam se podívat, pokud jen trošku ovládate angličtinu, nebo jste ochotni podstouput strojový překlad Googlu, je eupedia.com.
Tam naleznete velmi pěkné množství aktuálního materiálu, které by vám mělo dát do začátku rozumnou představu, kdo byli ti vaši otcovští předci zač.

Příště bychom se v části 2 podívali na tu druhou kategorii výsledků, naše Y-DNA shody. A v důsledku se pomocí nich zase vrátili k dnešní kategorii, dávné minulosti.

Pokud si chcete o GaP popovídat, neváhejte využít komentářů k blogu, nebo českých genealogických fór taby.cz a nebo klub na okoun.cz


Jo, a mimochodem, pokud se chcete GaP zúčastnit, tady je vstupní formulář: http://www.genebaze.cz/cgi-bin/gap/gap_ud.cgi

Cíle 2.2 roku 2017 - identifikace poloviny mých 7xpra dědy z otcovy strany

Pomalu se nám rok 2017 blíží ke konci, a já sotva napsal nějaký blog. Jak už jsem psal minule, bylo to hlavně kvůli narození našeho třetího dítka, a celkovému nedostatku času.

Jak jsem se i přesto vypořádal s vytyčenými cíli?
Se ctí můžu předvést alespoň jeden úspěch. Novou vlnu výzkumu předků mého dědy z tátovy strany - Emila Krcháka.

Na konci loňska jsem si tedy vytyčil cíl vypátrat alespoň polovinu mých 7xpra z dědovy strany.
A tady teď jsem (počet nalezených předků dědy Emila, generace na řádku):

Ač mi chybí už dva z mých 4xpra prarodičů, dokázal sem se dostat na vysněnou metu 64 7xpra. Další generace jsou bohužel zcela beznadějné...

Proč?
[- Na nějaké indexy pro takhle staré matriky rovnou zapomeňte. Zřejmé, ale velmi bolestivé.]
- Je náročné zkrotit s každou generaci dvojnasobný počet.
- Starší materiály jsou náročnější na práci. Žádné informace o rodičích, ani na svatebních záznamech, žádná čísla domů, žádná příjmení manželek...
- Neustálenost příjmení. Bohužel, příjmení nejsou ještě zcela fixována ani na přelomu 17ého a 18ého století.
- Některá příjmení jsou naopak velmi častá, a oplývá jimi klidně pětina vesnice.
- Čím hloubějí zkoumáme, tím širší množství far musíme pokrýt, a vypátrat v této době jakékoliv stěhování je obzvlášť oříšek...

Poznámka: všechen popisovaný výzkum probíhal na předtolerančních matrikách z Horňácka na actapublica, Velka nad Velickou [tehdy jen "Velká"].

Takže jak adresuju výšene uvedené problémy, abych si s nimi poradil?

1. Neustále si udržuju seznam aktuálních příjmení, a snažím se je zapamatovat. Prakticky to vypadá tak, že na 90% procentech obrazovky mám otevřenou matriku, a na zbylých 10ti mám úzký sloupeček s příjmeními.
   Není prostě možné, procházet stejnou matriku znova a znova, a hledat při tom jen jedno, nebo pár příjmení. Projít matriku jednou (několikrát málokrát) zapisujíce rovnou všechny výskyty z celého seznamu příjmení je mnohem efektivnější.
   A kolik příjmení je rozumné? Já se snažím zkoumat na jednou všechna příjmení svých 7x pra. Na táhle úrovni se už většinou trošku opakují. Takže ja jich teď mám 38 - některá neznám, některá se opakují a u některých vím, že jsou z jiné fary.
2. Udržuji si index všech svých předku napsaných tužkou na papíře.
   Kdykoliv potřebuju, můžu se podívat na vše co vím o svých předcích na této části stromu, se všemi jejich známymi daty a místu. Zcela nepostradatelná pomůcka.
3. Zapisuju si každý detail.
   Jenom důkladným výzkumem všech nositelů mých příjmení z celé fary dokážu odlišit jeden z mnoha páru, kde se muž i žena jmenují úplně stejně (bohužel neměli ti naši předci na křestní jména příliš fantazie). Bez čísel domů a příjmení manželek potřebujeme pomoc nepřímých informací jako jsou jména kmotrů, vztah narození dětí se smrtí matky.
   Obdobně jako u stejně se jmenujících párů nám tato technika přináší schopnost propojit několik vdoveckých vdavek tak, abychom věděli, že jde o stejnou osobu.
4. Trpělivost.
   Tohle všechno vyžaduje čas. Pokud nejste ochotni strávit 5 hodin a nezískat při tom jedinou informaci přímo o vašich předcích, tenhle postup asi není pro vás.
5. Začínám se svatbama.
   Rozhodně nejlepší způsob je vybudovat si kvalitní základnu dospělých párů a pak je ověsit dětmi. A až úplně nakonec to doplnit o údaje o úmrtích.
   Prakticky to dělám nějak takhle: první svatby pro generaci T, pak děti z generace T+1, znova svatby, z generace T+1, děti T+2, a konečně úmrtí T+2...
6. Ještě trochu víc trpělivosti.
7. A potom partneři, kamarádi, babičky a strýčkové.
   Já v tomhle směru moc úspěšný nejsme, ale všechno o čem píšu krásně škáluje s počtem lidí. Takže jestli můžete, zapojte ostatní.

Hodně štěstí vašemu předtolerančnímu výzkumu. Pokud se do toho pustíte pořádně, určitě zjistíte, že nejedna informace vašich vzdálených příbuzných o vašich předcích je nepravdivá - chybní rodiče, potomci dítka, které zemřelo po 5ti dnech, ap. A to je pro mě pěkná odměna za dobře odvedenou práci.

Na druhou stranu, bez pořádného DNA výzkumu je ten papírový strom jenom jedna velká hodně nejistá hypotéza.

2017 Goal 2.2 - half of my 7th great grandparents on paternal grandfather's side identified

So 2017 is running to an end and I have barely blogged. As I explained, it was largely due to my 3rd kid and first son being born and generally time being at a premium.

So how did I fare against my goals?
Well I can report at least one success. The research of my paternal grandfather, Emil Krchak.

The goal was to identify half of my 7th great grandparents on Emil's side of the family.
And here is where I am (number of identified Emil's ancestors, generation per line):

While I am already missing two 4th great grandparents, I managed to hit the coveted 64 7th great grandparents. Unfortunately after that, the amount on known ancestors totally plummets...

Why?
[- Forget indices. Obvious, but always a tough one.]
- It is hard to keep fighting the ever increasing number of ancestors.
- The older materials are harder to work with. No parent information even on marriage records, no house numbers, no surnames for wives...
- The instability of surnames. Unfortunately, it seems the surnames are not completely stable any longer around the 17th to 18th century transition.
- There are several surnames, that cover significant portion of a village.
- The deeper we go, the more locations we need to cover, and any move is very hard to track...

Note: these are all Hornacko parish records on actapublica, i.e. Velka nad Velickou [then "Velka"] parish pre-tolerance.

So what do I do to combat the problems above?

1. I maintain a list of all relevant surnames, and try to memorize it well.
   It is just not feasible to go through the same parish book over and over again, with one of few surnames in mind. Going through it once, or few times, with many surnames in mind is more time efficient.
   So how many? I try to cover all known 7th great grandparent surnames. They start to repeat, so this makes it around 38 surnames currently (some unknown, some repeated, some known to be in a different parish).
2. I maintain a pen&paper ancestral index at hand.
   Having a quick reference of my ancestors, with all relevant where & when is indispensable tool.
3. Note down every detail.
   Only by diligent research of every bearer of the surname in the parish can you distinguish the many occurrences of multiple pairs with the same name of husband & wife. Without house numbers, you need to use the indirect information - names of godfathers, alignment of children being born with mother's death.
   Similarly, only this can help you connect your multiple time widowed ancestor wedding information as being about the same person.
4. Patience.
   It takes time. If you are not willing to pull 5 hours of work without obtaining a single new bit of information about your actual ancestors, this approach is not for you.
5. Work on the weddings first.
   It is best to establish the known pairs who made it too adulthood, than decorate them with children. And only at last, fill in the details from the death records.
   The best approach to timeline for me being: generation T weddings first, then generation T+1 kids, then generation T+1 weddings, then T+2 kids and last but not least generation T+2 deaths...
6. Some more patience.
7. Have partners, friends, grandmas or great uncles work with you.
   Unfortunately, I did not succeed in this direction much, but clearly, all of the effort above scales well with people. Get them on board.

Best of luck to anyone, who decides to go for it. You definitely find matches with the wrong parents, descendants of a kid who died at 5 days of age, etc. when you compare your well researched surname results to less systematic research of some cousins. And that feels good.

On the other hand, without the DNA to back the tree up, it is all just a shaky hypothesis.

Vít, nový Krchák na světě!

Srdečné pozdravy všem čtenářům. Přijměte prosím mou omluvu za dlouho odmlku. Zmiňoval jsem se už, že vést dvojjazyčný blog je dvakrát víc práce než jednojazyčný blog?
A propos, už jsem zmiňoval, že tři děcka jsou vlastně jako dvě děcka, až na to, že na koníčky máte teda rozhodně míň času než dřív?

Nu což, vzhůru do práce. Nejste tady, aby jste poslouchali, jak si stěžuju.

Takže Vít. Vítek Krchák. Třetí v této (~2010) generaci Českých Krcháků. Po pravdě nic moc. Zdá se, že Krcháci v Čechách do pár generací vymřou.

A kdo tedy jsme? My chlapi, Krcháci? Z Horňácka, jihovýchodní Moravy, kraje chudého, ale na tradice bohatého? Mé první nakouknutí na naši otcovskou linii se odehrálo pomocí autozomálního testu u 23andMe, verze 4. Ten obsahoval několik tisíc SNiPů na Y chromozomu.


Podle jejich starého způsobu značení jsem byl I2b*. Nicméně trošká výzkumu proti Y stromu na ISOGG ukázala, že jsem ve skutečnosti větev I-M423, tedy I2a1b starou notací. Větev původních Evropských lovců a sběračů - Evropan jak poleno :D
23andMe nabízí o Y haplogrupách vlastní povídání, ale zdaleka nejlepší info jsem se dočetl na eupedii. Hlavně tam jsem se dověděl o základní historii I-M423.

Po trošce průzkumu jsem jasně viděl, že SNiPy jsou na výzkum chromozomu Y mnohem mocnější zbraň, než STRka. Díky jednoznačnosti a bohatější struktuře. Jako další krok jsem si tedy vybral I-M423 panel na yseq.net. To je Y test s daleka nejlepším poměrem cena výkon na trhu (pokud znáte svoji haplogrupu), a tým z yseq.net dělá vše proto, abych jejich panely zahrnovi vždy ty nejnovější známé mutace. Velká chvála Thomasovi Krahnovi.
Výsledky panelu mi poskytly mou "konečnou" (z hlediska dosud dosažených znalostí o Y stromě) SNP mutaci I-Y16473 and 4 nejbližší shody - Narog, Telencio, Rohaly and Girya. Polsko, Polsko, Maďarsko a Ukrajina. Nejbližsí společný předek 200 n.l. Expanze Slovanů na západ!
Úžasné.
Být schopen si spojit mutaci I-S17250 a její nejbližší podtřídy tak zřejmě se Slovanským stěhováním národů v první polovině prvního tisíciletí našeho letopočtu byl jeden z nejlepších výsledků, co jsem zatím z genetického testování dokázal vymáčknout.



Dalším krůčkem ve výzkumu mé Krchákovské linie bylo dohánět co jsem zanedbal - malý STR test. Ten jsem uskutečnil pomocí unikátního českého projektu "Genetika a příjmení", které se snaží mapovat česká příjmení na haplogrupy - genebaze.cz/gap.html. Pokud jste to ještě nezkusili, rozhodně se ozvěte! Je to úžasný způsob jak zadarmo s genetickým testováním začít.
Tak co jsem se dověděl? Jak by mohl malinký STR panel dodat nějakou informaci k SNP testu, obsahujícím všechny nejnovější větve? Jednoduše. Všude je TOLIK genealogů, kteří si nechali udělat jen STR test. Takže ač je SNP testování rozhodně mocnější co se týče časové umístění vašich shod a vytvoření stromu otcovských linií, neměli by jste STRka rozhodně zcela vynechat - umožní vám získat další (trochu neurčité) shody.
V mém případě to znamenalo nějaké blízké Slovenské shody, které žadné SNP testování nepodnikly. To krásně podpořilo rodinou legendu, že Krcháci přišli na Horňácko ze Slovenska.
(To je navíc dále podpořeno Slovenskými autozomálními shodami na čtvrtine DNA od mého dědečka Krcháka.)
Macák. Orava. Doufám, že jednou je na SNP test nalákam.
Moje IDčko na ysearch.org je AH7EK. Rovněž rovázané s mým WikiTree účtem.

Jak vždy říkám, jsou dvě cesty kterýma se může člověk ve světě Y-DNA vydat. Aktivní nebo pasivní.
Pasivní znamená čekat, až vaše shody absolvují všemožné testy, až vám vydláždí cestu. Je to ta levnější cesta. Ale možná vás nikam nedostane.
Aktivní znamená konat! Udělat si sekvenování chromozomu Y. Najít vaše nové mutace. Spolupracovat s testovacíma společnostma, aby jste vaše soukromé SNiPy dostale jak do panelů, tak do dlouhých seznamů testů na samostatné SNiPy. Pracovat s vašimi shodami, zda nemají některé vaše mutace společné. Snažit se navnadit vzdálené bratrance, aby se do toho sekvenování taky pustili. Tohle je mnohem dražší varianta, ale povede k výsledkům mnohem pravděpodobněji, v mnohem kratším čase.

Ja si samozřejmě vybral tu aktivní cestu. Takže můj další krok byl logicky BigY test of FTDNA. Nebo ne?

Aby jste si od FTDNA mohli koupit BigY test, musíte u nich první otestovat nějaké STRka. Ono je to nakonec asi v pořádku, protože nikdo nechce utratit 400 dolarů, aby zjistil, že jeho bratranec měl ve skutečnosti adoptovaného pradědečka.
Pomocí projektu je možné si objednat 12STR, aby člověk minimalizoval náklady. Ale když už se má člověk do té FTDNA STR databáze dostat, tak ať ty shody stojí zato. Začal jsem raději rovnou s 37STR indikátory. Tedy asi 15 navíc proti těm co už jsem měl z GaP.

Stálo to za to? Ani ne. Šel bych do těch 37mi radši než do 12ti znova? To zas jo.
Problém je, jak přísný limit na shody FTDNA na úrovni 37STR indikátorů má. Snaží se motivovat lidi ke koupi 67mičkových a 111kových panelů. Je to hnusná vydírací taktika, ale holt to tak je. FTDNA si na živobytí vydělává hlavně pomocí STR testů, a vždycky se snažila tu být předně pro genetické genealogy (ne jako některé jiné společnosti, kterým jde opravdu jen o zisk).
Takže 37STR test žádné nové poznatky nepřinesl, ale vždycky může zkoušet všechny své blízké STr shody přesvědčovat na BigY test.

Se splněnou podmínkou v podobě STR testu byl BigY konečně na dohled. Akorát byl dál, než to vypadalo. Několik odložených slíbených časů dodávky, a déle než 3 měsíce čekání... Ale když jsem se konečně dočkal tak to rozhodně stálo za to.

Nová finální větev s mou shodou - Larrym Telenciem. I-FGC40352. Paráda. Skvělé. Úžasné. Takhle se tvoří Y strom.
Navíc jsem dostal 8 soukromých mutací, které teď čekají na další shody.
Potenciál pro další výzkum, blíže současnosti. Sem s ním!

A tím se jako s testováním skončil? Ne tak úplně. Sekvenování je známé nelehkostí interpretace. A FTDNA to dělá obzvlášť blbě. Proto taky většina lidí, která Yové sekvenování podstoupí, jde o krok dál. Objedná si detailní analýzu souboru BAM za 49$ na https://www.yfull.com.
Tam se výsledky dostávají postupně:

1. SNP výsledky - tohle je podstata analýzy, najív nové finální listy v Y stromě a identifikovat vaše soukromé mutace (a míru jejich spolehlivosti).
2. STR výsledky - několik stovek STRek, které se dají pomocí NGS přečíst. A taky STR shody.
3. nový Y strom - vám konečně ukáže vaši novou, vysněnou větev Yového stromu s vaší soukromou mutací - a odhadem jejího stáří.

Tak jsem s tím výzkumém Y chromozomu, co můj syn ponese dál do budoucnosti, docela pokročil, ale stále je kam jít.

Přesvědčit blízké shody, aby rovněž absolvovali sekvenování chromozomu Y, a nebo alespoň otestovali přítomnost mých soukromých mutací v jejich DNA. Snad se mi to u některých (z Vás) podaří.
Koupit BigY pro známé vzdálené bratrance po otcovské linii, abychom lépe definovali, které z mých soukromých SNiPů jsou ty starší. A rovněž za účelem umístění Krchákovské větve na rozličné Y stromy (YFull, ISOGG, FTDNA).

Další rok, další krok kupředu. Už se těším co se na poli Y výzkumu dovím v roce 2018.

Jo a taky si můžu odškrtnout můj první cíl ze seznamu na rok 2017. Uff.

Vitus, new Krchak introduced into the world!

Hello everyone and sorry for the prolonged hiatus. Did I ever mention that maintaining a bilingual blog is twice the work of maintaining a single language blog?
Also, did I ever mention that taking care of three kids is almost the same like taking care of two, but it still means you will have even less time for your hobbies as a result?

Well, let's get to work then. You aren't here to hear me complain!

So Vitus. Vitus Krchak. Third in this generation (~2010 generation) of Czech Krchaks. We are on the verge of extinction.

So who are we? Male Krchaks? Coming from Hornacko region, in south east Moravia? I started glimpsing into the paternal linage by taking the 23andMe autosomal V4 test, that included several thousand Y chromosome SNPs.


I was denoted I2b* branch, but some small research against the ISOGG Y tree revealed I am actually I-M423, I2a1b branch.
23andMe offers some haplogroup history write-up on their own, but the best source is probably eupedia. There, I learned about the basic I-M423 history.

I clearly saw that SNPs are so much more powerful for Y research than STRs and chose the next step as a I-M423 panel at yseq.net. This is a great price performance ratio, and the yseq.net team goes out of their way to always keep their panels updated with latest developments. Big kudos to Thomas Krahn and team.
This offered me my terminal SNP of I-Y16473 and 4 closest matches - Narog, Telencio, Rohaly and Girya. Poland, Poland, Hungary and Ukraine. Most recent ancestor 200AD. Slavic expansion!
Awesome.
To be able to identify the I-S17250 and it's nearest subclades so clearly with the Slavic expansion in early centuries of AD was a great feeling and justification of the testing effort.



The next step in my Krchak lineage research was a small STR test. This was done for free thanks to a great Czech project "Genealogy and surnames", which tries to map various surnames to haplogroups - genebaze.cz/gap.html (Czech only).
So what did I learn there? How could a small STR test add something to state-of-the-art SNP test? Easily. There SO MANY genealogists, that have only done STR testing, that while SNP testing is superior, to provide better timeline and paternal tree, you should not omit STRs.
In my case, this meant some close Slovak matches, that have not done SNP testing, that hint at correctness of the family lore, that Krchaks came to Hornacko region from Slovakia.
(This is further strengthened but quite close Slovak autosomal matches on my paternal grandfather "quarter" of my DNA.)
Macak. Orava. I hope I will get them to test some SNPs one day.
The ID on ysearch.org is AH7EK. Which is also linked to my WikiTree account.

As I always say, there are two approaches, you can take with your Y reseach. Active or passive.
Passive means waiting, for your matches to test, for them to pave you the SNP way. It is the cheaper road. Yet, it may never get you anywhere.
Active means acting. Testing that NGS Y chromosome test. Finding your novel SNPs. Working with the testing companies to get some of them on their panels and their single SNP tests. Working with your matches to try to verify if they have any of these SNPs common with you. Trying to motivate your distant cousins to do a NGS Y chromosome test too. This will be (much) more expensive but will lead to results so much more likely so much faster.

Of course I choose the active path, so here I was, buying a Big Y test from FTDNA. Or was I?

FTDNA requires you to purchase a STR test, before buying a BigY test. This is probably fair, because you don't want to spend 400$ on your cousin to find he was a NPE.
You can order a 12STR test through a project, to save most money, but I wanted to tackle FTDNA STR database and went for 37STR markers. This added roughly 15 on top of what I had from GAP.

Was it worth it? Not much. Would I do it again? Yes.
The FTDNA limit for matches on 37STR level on FTDNA is very strict to motivate you to purchase 67 or 111 panel. I consider this an ugly money-poaching tactic, but it is, what it is.
FTDNA earns their living off of STR testing after all.

Nothing tangible I got from the 37STR test, but there is always a chance to persuade some of my matches to test BigY. Study modal STR values on various SNP levels, etc.

With the STR test out of my way, the BigY was finally in sight. Except it was further than it seemed, taking over 3 months... Eventually, the test happened, and boy did it deliver.

New terminal SNP with my match Larry Telencio. I-FGC40352. Super awesome. Super exciting. Y-tree in the making.
On top of that I got 8 unnamed variants (that actually included two named SNPs, but nevermind).
Potential for further research closer to present. Give it to me!

Was I done? Not yet. The NGS test are notoriously hard to analyze. And FTDNA does not do a very good job. That is why everyone who takes Y research seriously goes one step further and orders detailed analysis of his BAM file for 49$ on https://www.yfull.com.
There are three milestones:

1. SNP results - this is the foundation of the analysis, finding any new terminal SNPs
2. STR results - this offers a more profound look at the STR landscape
3. new Tree being published - this finally offers the age estimate of your new terminal SNP

All in all, I am fairly advanced in terms of my Y research, that my son will carry.
Still, more things remain.

Persuading close matches to test BigY or my novel SNPs. I hope I will succeed with some of them (you).
Buying BigY for known distant cousins so that we can better define the older novel SNPs and the most recent one, as well as get the branch on various trees (YFull, ISOGG, FTDNA).

Another year, another step forward. I am looking forward to learning more in 2018.

Nová verze 23andMe i pro Čechy!

Rád bych se vrátil ke svému blogu, a k tomu citím, že je zapotřebí přeložit posledni článek z února, abych dostál česko-anglické paritě a mohl jít dál.

Co tedy budeme dohánět?

23andMe konečně ohlásila, že bude převádět zahraniční účty bez zdravotních výsledků - takže Británie, Kanada a Dánsko maji zatím smůlu. (dnes, v říjnu, už je tedy převedeno vše).

Co nám tahle změna přinese? Trochu horší práci s našimi shodami :( To je na té přicházející změně asi nejhorší - nový vzhled a ovládání je směřováno na začátečníky a nenabízí takovou rychlost a důraz na výsledky, jako staré stranky. Navíc veledůležitý chrome plugin 529andYou nepracuje zcela automaticky, což bude při práci s velkým množstvím dat rozhodně chybět. 23andMe mám ze všech stránek nejradši právě kvůli výborným schopnostem pluginu 529andYou, který umožňuje ověřovat triangulační skupiny téměř bez námahy.

Na druhou stranu, máme na co se těšit:

1. Souhlas s pozvánkama, hurá! Mám už asi 4 měsíce zabugovaný účet, neschopný odsouhlasit pozvánku od někoho jiného.
2. Čtení a psaní zpráv! Dvakrát hurá!! Můj účet, asi kvůli velkému množství shod, už neumožňoval čtení nových zpráv. Má omluva všem co mi psaly a nikdy se nedočkali odpovědi. 
3. Schopnost ozvat se anonymním shodám! Konečně se budeme zase schopní ozvat anonymním shodám. Často ani neví, že jsou "anonymní" a nemají žádný problém sdílet.
4. Nová funkcionality In-Common-With - "společné shody". Tohle bude strašně důležitá nová vlastnost, která nám umožní rychle nahlédnout, kdo je s kým příbuzný.
5. A spousta dalších drobnosti, jako například novější informace o můžských haplogrupách.

Rád bych využil téhle příležitosti, a vyslal ještě jednu vlnu pozvánek. Kdo ví jak budou věci vypadat. Jedna věc je jistá - schválené shody zůstavají schválenýma shodama i skrz přesun na nové stránky.
Takže zřejmě schválené shody = dobrá věc :)

Pokud jste náhodou má shoda, moc rád vám pomůžu s lepším porozuměním genetické genealogii - nebo s lepším porozuměním vašim středoevropským, především českým předkům.
I když vás nic z toho nezajímů, moc pomůžete výzkumu našich společných kořenu, pokud odsouhlasíte mou nabídku ke sdílení. Umožní mi to lépe stanovit triangulační skupiny, kusy DNA mě a mých shod z konkrétního společného předka. Sdílení mi umožní vidět jen ten malý kousek DNA, který sdílíme a nenese žádné bezpečnostní riziko.

Také bych rád udělal novou verzi naší série o sdílení. Jak se situace změnila od ledna?

Tady je porovnání s posledním loňským blogem:

	DNA shody	Anonymní	Odsouhlasené	% odsouh.
já (Kuba)	952 (+6)	214 (-25)	381 (+21)	40.02%
matka	854 (+9)	239 (-32)	311 (+25)	36.42%
otec	918 (+2)	196 (-33)	391 (+30)	42.59%
bab. z m. strany	1122 (+19)	293 (-9)	516 (+21)	45.99%
bab. z o. strany	925 (+5)	241 (-34)	337 (+11)	36.43%
děd. z m. strany	957 (+14)	229 (-28)	357 (+23)	37.30%
manželka	898 (+8)	224 (-50)	304 (+29)	33.85%

Zajímavé, že všechny ty změny jsou bez jediné pozvánky.

A přesto se nám daři u některých profilů překonat magickou 40% hranice! Paráda.
Přestože je poslední dobou na 23andMe slyšet dost negativních reakci (na facebooku, různých fórech), já můžu směle říct, že počet shoda roste na úplně všech profilech.
A zároveň klesá počet anonýmních shod, často téměř rychlostí světla - když z manželčiného seznamu shod jich ubylo celých 50.

Vychází mi jednoduché pozorováni. Dokud budete své shody pozývat ke sdílení, statistiky budou vypadat pěkně. Budete mít víc a víc bratranců a sestřenic ke zkoumání.

Jak jsou na tom neodsouhlasené pozvánky? Podívejme se:

Šest zabugovaných pozvánek. Snad zůstanou i po přechodu.

A víc než tři a půl tisíce neodsouhlasených shod. Včetně těch nejbližších. Moc doufám, že tahle vlna pozvánek dokáže některé z mých shod zastihnout. Dostat to dolů na 3000 by bylo úžasné ;)

Ja bych se na to nové 23andMe díval s pozitivními emocemi. Čekají nás nové skvělé nástroje. Stejně jako staronová schopnost pozvat ke sdílení anonymní shody.

A v neposlední řadě teď tvrdě (jak jen čas dovolí) makám na rodokmenu, takže napojovat shody bude zase jednodušší. Doufám :D

23andMe move to the New Experience coming!

So 23andMe has finally gotten to transitioning foreign accounts WITHOUT health information - sorry UK, Canada or Denmark.

What will it bring? Worse ability to work with DNA relatives :( That's the biggest bummer, the new interface is more newbie oriented and does not offer as quick and outcome oriented  capabilities as the old one. Also, the 529andYou chrome plugin does not work perfectly (at least yet), that is going to be a big downside. I only like 23andMe most to work with, because of the powerful plugin 529andYou made work with triangulations so effortless.

On the other hand, we have a lot to look for.

1. Accepting invitations, yay! Yes I had my account bugged for maybe 4 months now, unable to accept any invitations from others.
2. Reading and writing messages! Yipeee!! Again, my account, due to it's size, probably, was no longer able to read new messages from people. Sorry everyone! 
3. Contacting Anonymous matches! Finally, we will be able to contact anonymous people again. They often do not know they are anonymous and are perfectly fine with sharing.
4. New In-Common-With functionality. Huge! I am so looking forward to learning where do my anonymous matches fit. And others as well.
5. All other little nice things like updated male haplogroups.

I want to take this opportunity to run one last invitation wave on the old site. Who knows how things will be, and one thing is clear. Any matches you have persist through the transition.
So clearly matches = good :)

If you are my match checking up here, I would love to help you understand genetic genealogy or be able to understand your Central European, or even Czech ancestry better.
Still, if you are not interested in any of that, and can just approve my sharing request, that will help me a bunch in my family research. It will enable me to better define triangulations, portions of my and my matches' DNA coming from a specific ancestor. This will only show me a very small portion of the DNA we share and poses no security risk.

I would also like to do an update to my matches series. Where did we get since January first?

Let me compare against the last blog series from December 28th:

	DNA matches	Anonymous	Accepted	% accepted
me (Kuba)	952 (+6)	214 (-25)	381 (+21)	40.02%
mother	854 (+9)	239 (-32)	311 (+25)	36.42%
father	918 (+2)	196 (-33)	391 (+30)	42.59%
m. grandma	1122 (+19)	293 (-9)	516 (+21)	45.99%
p. grandma	925 (+5)	241 (-34)	337 (+11)	36.43%
m. grandpa	957 (+14)	229 (-28)	357 (+23)	37.30%
wife	898 (+8)	224 (-50)	304 (+29)	33.85%

What is important to say, is that this was without any invitation messages being written. Nada.

And we're still breaking the magical 40% accepted on some kits already! Sweet.
Despite the negative sentiment everywhere (facebook, forums), I can still report number of matches growing on ALL of my kits.
WHILE, number of anonymous matches dropping, sometimes at a speed of light - 50 anonymous matches disappearing from my wife's list. WOW.

Simple observation. As long as you keep inviting your relatives to share, you should be good. See more and more cousins to research.

So where are we with unaccepted matches? Let's see:

Hm, 6 bugged invitations. Hope they stay for the TNE.

And over three and half thousands of unaccepted invitations. Including some of the closest ones. I sure hope this invitation round will reach to some of these cousins. Getting down to 3000 would be awesome ;)

So let's look forward to the New Experience with positive attitude. There are some great new features in there. As well as a renewed possibility to connect with anonymous matches.

And last but not least, I am working on my tree hard (as time permits) so I can find a connection for all of these new matches :)

Cíle na rok 2017

Nejpředněji: Vše nej v novém roce! 🎉🎉🎉 Ať je pro Vás velmi vydařený, se spoustou genealogických ůspěchů, mnoho nových DNA shod a hlavně jen a jen zdravé rodinné příslušníky.

Nový rok je vždy skvělá příležitost udělat si ve věcech pořádek a pustit se do toho s novou vervou.

Takže čeho bych rád dosáhnul? Některé cíle jsem již zmiňoval ve dvou posledních bilančních blozích. Zahrnuji je tedy do celkového seznamu, který seřadím podle důležitosti.

1. Mít zdravého syna. Juchúúú! Nejde o čistě genealogicky ani čistě genetický cíl, ale péče o novorozeného syna bude určitě z toho nejzajímavějšího, co 2017 nabídne. Za daň padne nějaký ten volný čas - takže prosím omluvte případné delší odmlky. Rovněž bych rád touto formou obrovsky poděkoval své úžasné ženě. Díky lásko, miluju Tě 💖
   
2. Zdokonalit rodokmen. Tomuto tématu a jeho podbodům jsem se věnovali v posledním loňském bilančním blogu.
   
   2.1. Identifikovat 40% mých vlastních předků do 10té generace včetně. To znamené identifikace 818ti předků (z celkových 2046ti). Dnes jich [pravděpodobně] znám 512. To tedy znamená identifikovat dalších 306 nových předků v roce 2017.
   
   2.2. Nalézt polovinu předků mého dědy z otcovy strany v 7mé generaci - tj. 64 mých prapraprapraprapra.
   
3. Napsat sérii blogů v češtině pro začátečníky s genetickou genealogií.
   
4. Najít alespoň jednoho z mých dvou nejbližších neznámých předků. Jeden pradědeček mé babičky z otcovy strany a jeden pradědeček dědy z otcovy strany jsou neznámí (babičky byly nemanželské). Atakovat jejich identitu pomocí DNA je od začátku jeden z hlavních plánů mé geneticko genealogické kariéry. Kdyby se podařilo alespoň jednoho najít, byl by to signifikantní výsledek.
   
   4.1. Tento cíl zahrnuje sběr maximálního možného počtu relevantních DNA vzorků na otcově straně rodiny.
   
   4.2. Pracovat na rekombinační mapě otcovských chromozomů a maximalizovat pokrytí předky.
   
5. Otestovat naše děti. Se ženou jsme se shodli, že do toho půjdeme, za pár let to bude běžná součást poporodního vyšetření. Takže najít nejlepší možnost a uskutečnit ji bude jedna ze zajímavých částí 2017.
   
6. Začít sloupek "Předek týdne" - kde podrobně bloguju o jednom ze svých zesnulých předků. Předpokládám, že jich za rok zvladnu jen pár, ale těším se na to.
   
7. Pokračovat v práci s genetickýma shodama - kde součástí tohoto cíle jsou i detailnější plány z nedávného bilancování shod na 23andMe.

Určitě bych toho rád stihl víc, ale znáte to - kdo chce moc, nemá nic. Zůstanu tedy u 7. Budu se snažit každému z těchto cílo v tom novém roce věnovat, s prioritou shora dolů.

Goals for 2017

First and foremost: Happy New Year! 🎉🎉🎉 May you all have a very successful 2017 with lot of genealogical successes, uncovered DNA cousins and healthy family members.

A new year is a great time for tidying up and starting afresh with new vigor.

So what are the goals I want to achieve? I have already mentioned some of them in my last two blogs, but I will incorporate those into the overall list with order by importance.

1. Have a healthy son introduced into the world. Yay! This is not strictly genealogical, nor strictly genetical, but taking care of my newborn son will be a great experience in 2017. It will take away some of my free time - so excuse in me in times of silence. Importantly, here comes a huge thank you to my wife, for being such an excellent person and mother. Love you, honey 💖
   
2. Improve the family tree. This has subgoals as per the latest 2016 balancing blog.
   
   2.1. Identify 40% of my own overall ancestors up to the 10th generation. This means identifying 818 ancestors of mine (out of 2046). I currently [think I] know 512 of them. This means identifying 306 new ancestors of mine in the new year 2017.
   
   2.2. Identify half of my paternal grandfather's 7th generation. I.e. 64 ancestors. This is an ambitious plan, as I have not reached 64 ancestors on this level for none of my other grandparents. But it is important to aim high.
   
3. Run a Czech series for newbies in genetic genealogy. (This will probably be Czech only - there is a lot of existing English material and maintaining bilinguality costs a lot of time and energy).
   
4. Break one or both of my closest brick walls. One of my paternal grandmother's great-grandfathers is unknown, as well as one of my paternal grandfather's great-grandfathers. Attacking them with autosomal DNA was the goal from the beginning, so identifying one or both of them would be a tremendous achievement.
   
   4.1. This includes a sub-goal of gathering as much relevant samples from those sides of the family as possible.
   
   4.2. Work on recombination map and chromosome ancestral coverage on my paternal side.
   
5. Test my own children. We have agreed with my wife to test the children, so looking into what's the best option and going through with it is one of the topics of 2017.
   
6. Start an "Ancestor of the week" feature - were I blog about one of my ancestors. I expect only a few of these throughout the year
   
7. Keep working with my genetic genealogy matches (this includes 23andMe matches and the relevant goal mentioned in the recent 2016 balancing blog).

I have more on my mind, but let's keep it at 7. I will try to address each and every one of these goals, with the priority going top to bottom.